1芯片生物信息學服務
對基因芯片的表達譜數據進行預處理與歸一化分析,篩選顯著差異表達的基因,對差異表達的基因數據進行聚類分析,進行規?;娜旧w定位分析和基于染色體和轉錄因子的轉錄調控分析,并結合基因分類數據庫和信號轉導數據庫進行基因的分類和注釋、相關代謝路徑和信號通路的分析。
2芯片生物信息學服務類型
? 差異表達基因分析和聚類分析
基因芯片數據標準化、上調基因/下調基因、t-檢驗(P值)、方差分析(F-檢驗)、基因聚類(Cluster)、熱圖(Heatmap)、多樣本分子標志物聚類(如腫瘤分子標志物聚類分析)??煞治鰉RNA表達譜、miRNA表達譜和甲基化基因芯片數據表達譜差異。(結果形式:分析表格、紅綠熱圖、Cluster分類樹)
? 基因數據相關性分析
分析內容:基因芯片數據質量控制和分析(結果形式:相關性分析結果表格)。
? GO差異基因功能富集分析(Gene Ontology)
意義:可以告訴研究者差異基因所調控的生物學功能中哪些是最重要的, 哪些生物學過程需要深入研究,哪些酶的活性需要重點關注等。
分析內容:包含基因芯片內所有差異表達基因的GO功能注釋(結果形式:注釋表格)和GO功能富集分析圖(結果形式:熱圖Heatmap/聚類Cluster/功能調控圖)。
? Pathway分析
意義:了解差異基因影響的主要信號通路調控機制和重點調控的蛋白。
分析內容:最重要的幾個差異基因相關的KEGG代謝通路圖、表示通路被調控程度的熱圖,(結果形式:pathway表格)、Pathway富集分析圖(結果形式:熱圖Heatmap/聚類Cluster ,富集參數表格/KEGG代謝通路圖,含研究基因的顏色標記)
? 甲基化位點分析
分析內容:甲基化位點分布,高甲基化/低甲基化位點分布(結果形式:餅圖或柱圖)
? SNP位點分析
分析內容:分析某一細胞信號轉導通路機制或某一疾病相關的主要SNP位點。(結果形式:分析表格)
3 服務流程
4 服務優勢
技術保障:密碼子公司擁有經驗豐富的專家隊伍,全程為您解決技術與服務疑問,定期更新項目信息、及時追蹤您的項目進展。
便捷的在線訂單系統:網絡在線訂購和數據檢索服務,方便您下訂單并查閱數據。提供測序數據存檔,技術支持及在線留言功能。
5實驗結果交付
序號
名稱
交付形式
1
差異表達基因分析和聚類分析
分析表格、紅綠熱圖、Cluster分類樹
2
基因數據相關性分析
相關性分析結果表格
3
Gene Ontology
熱圖Heatmap/聚類Cluster/功能調控圖
4
Pathway分析
熱圖Heatmap/聚類Cluster ,富集參數表格/KEGG代謝通路圖,含研究基因的顏色標記
5
miRNA靶點基因預測
注釋表格
6
甲基化位點分析
餅圖或柱圖
7
SNP位點分析
分析表格